En Uruguay, la investigación en y con seres humanos está regulada por el Decreto 158/019. El CEI de la FCEA enmarca su actividad en dicha legislación nacional así como en las pautas y normas internacionales sobre ética de la investigación. Para la elaboración de su reglamento interno se han tomado en cuenta los documentos de funcionamiento de varios CEI locales e internacionales.